Владимир Молдавер после окончания Брянского института транспортного машиностроения начал работу на Московской железной дороге в 1983 году мастером локомотивного депо Унеча, где позже прошел путь от главного технолога до главного инженера депо.
В 1994 году был назначен заместителем главного инженера Брянского отделения МЖД, затем главным инженером, первым заместителем начальника отделения.
В 2002 году В. Молдавер занимал должность начальника службы локомотивного хозяйства Московской железной дороги, затем стал заместителем начальника дороги по локомотивному и вагонному хозяйствам.
С 2003 по 2004 г. руководил Московско-Курским отделением столичной магистрали, а затем был первым заместителем начальника Московской железной дороги.
С июля 2007 г. по ноябрь 2009 г. занимал должность начальника Южно-Уральской железной дороги.