Как было отмечено, запланировано строительство аэродрома Зырянка в другом, незатопляемом месте. При этом руководитель Росавиации выразил готовность рассмотреть возможность переноса проектных и строительных работ по аэропорту в рамках нового нацпроекта «Эффективная транспортная система» с 2028–2029 года, как было предусмотрено ранее, на 2025–2026 годы.
Зырянка (входит в состав ФКП «Аэропорты Севера») регулярно попадает в зону подтопления, ее аэродром по сути находится в пойме периодически выходящей из берегов реки. Из-за паводка происходит размывание боковой полосы безопасности. В такой период могут летать только вертолеты.
Власти Якутии ранее направляли предложение о модернизации аэропорта с переносом площадки и обустройством искусственной взлетной посадочной полосы.