В Таллиннском аэропорту действуют 15 авиакомпаний, которые осуществляют регулярные рейсы в 39 пунктов назначения. Больше всего перевозок осуществляет латвийская компания airBaltic с прямыми рейсами в 21 пункт назначения (28% всех пассажиров) и Ryanair, которая предлагала прямые рейсы из Таллина в 11 пунктов назначения (17% всех пассажиров). Самыми популярными направлениями были Стокгольм, Рига и Франкфурт.
В 2023 году пассажиропоток аэропорта составил 2,96 млн человек, что на 7,8 % больше, чем в 2022 году.