Однако, поскольку мультимодальные перевозки подвержены большим рискам, нежели перевозки одним видом транспорта, они требуют страхования не только по общим группам рисков (все риски, риски крушения, аварии и т. д.). В полисе необходимо отдельно отмечать страхование при проведении погрузочно-разгрузочных работ, страхование на период временного хранения в местах перегрузки с одного транспорта на другой.
Отдельно страховые компании могут застраховать риски задержки или финансовых потерь, ответственность перед третьими лицами, расходы на привлечение специалистов, инспекторов, на утилизацию поврежденного груза, его дезинфекцию или перенаправление по нужному адресу в случае ошибки.
Договор страхования может заключаться как на весь период перевозки, начиная от погрузки и заканчивая окончанием разгрузки в месте назначения, так и только на определенные этапы, например, до, после или между стадиями транспортировки.