В аэропорту Санкт-Петербурга создан оперативный штаб для совместной работы с авиакомпаниями, государственными контролирующими органами, органами местной власти и Роспотребнадзором (РПН) по вопросам COVID-19. В международном секторе Пулково выделена специальная зона для организации рабочих мест представителей РПН. В обслуживании вывозных рейсов принимают участие около 30 сотрудников управляющей компании аэропорта Пулково «Воздушные ворота Северной столицы» (ВВСС): представители операционной и технической дирекций, врачебных здравпунктов, служб пассажирских перевозок, перронного и бытового обслуживания, обработки багажа, специалисты по взаимодействию с органами власти и сотрудники других подразделений аэропорта. Персонал оперативного штаба Пулково полностью обеспечен средствами индивидуальной защиты: респираторами, перчатками, очками, защитными костюмами, средствами для обработки, антисептиками и салфетками.
ВВСС реализуют мощный комплекс мер против COVID-19 и исполняют все предписания РПН. В пассажирском терминале Пулково в зонах регистрации и контроля нанесена специальная разметка для соблюдения безопасной дистанции. В местах общего пользования установлены дозаторы с антисептиком для рук. Усилен режим уборки помещений аэропорта и контактных поверхностей, в том числе лифтов, лестниц, стоек регистрации, зон досмотра, трапов и пассажирских автобусов. Воздух в терминале аэропорта обеззараживается с помощью ультрафиолетовых рециркуляторов. Персонал Пулково регулярно получает защитные маски, перчатки, антисептические салфетки и гели. Пассажиры и встречающие могут приобрести средства индивидуальной защиты в специальных автоматах при входе в аэропорт, в залах регистрации, ожидания внутренних рейсов и выдачи багажа, а также в магазинах и аптеках аэропорта. Медпункт Пулково работает на втором этаже пассажирского терминала.